柳州航道养护中心成立于1956年1月，始称柳州航道工程区，1989年改称柳州航道管理处，2008年改为柳州航道管理局，2019年更为现名。是自治区交通运输厅下属的航道养护机构，是直属自治区港航发展中心的公益一类事业单位，负责行使融江、柳江、黔江及红水河共658.9公里的航道航标养护工作。主要职责：承担辖区航道及航道设施的养护和应急处置工作；承担辖区航道除军用航标和渔业航标以外的航标设置和维护工作；承担辖区养护航道的信息收集和服务工作；承担辖区船闸运行的具体协调调度工作。根据自治区财政事权和支出责任划分改革要求，自2022年开始还承担红水河乐滩电站以上至省界、融江麻石电站以上至省界共484.7公里航道养护业务检查和监督职责。同时代自治区港航发展中心履行辖区航道基础设施建设项目业主职责，目前承担来宾至桂平2000吨级航道工程、柳江红花枢纽至石龙三江口Ⅱ级航道工程2个项目建设现场管理任务。

柳州航道养护中心内设9个职能科室，分别是：办公室、人事科、财务审计科、党委办公室（增挂监察室）、设备管理科（增挂安全管理科）、航道管理科、航标管理科、科技信息管理科、离退休人员工作科（工会）。下设6个直属机构：航道疏浚处、测绘处、柳城分中心、龙城分中心、武宣分中心、来宾分中心。4个分中心下设18个航道站（点）。

辖区航道流经柳州、河池、来宾、贵港4市20区县行政区域，养护航道范围全长1143.6km，设标总里程1143.6公里，共设置各类助航标志1188座。辖区内有龙滩电站、岩滩升船机及麻石、浮石、古顶、大埔、红花一二线、大化、百龙滩、乐滩、桥巩、大藤峡11座枢纽船闸。

近年来，在自治区交通运输厅和自治区港航发展中心的坚强领导下，柳州航道以建设人民满意航道为目标，团结带领全体干部职工攻坚克难，群策群力，在全力推动航道事业又好又快发展过程中收获累累硕果，先后被授予自治区级“文明单位”、“全国模范职工小家”、 “全国文明单位”、“全国交通运输系统先进集体”等荣誉称号，2021年，获自治区交通运输厅评为年度交通运输工作突出贡献集体。